Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms