Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Chd2E9PZM4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd2E9PZM4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms