Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5415E9PXF3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5415E9PXF3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms