Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl3E0CZ16 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl3E0CZ16 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms