Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7Q2

Smim20, Small integral membrane protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim20D3Z7Q2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim20D3Z7Q2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms