Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms