Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptrhd1D3Z4S3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms