Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms