Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms