Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc13D3YV10 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc13D3YV10 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms