Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms