Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms