Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pnldc1B2RXZ1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pnldc1B2RXZ1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms