Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Abcc8B2RUS7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Abcc8B2RUS7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Abcc8B2RUS7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms