Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprbB2RU80 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms