Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prrt4B2RU40 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms