Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3aB1AWZ3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms