Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NhsB1AV60 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NhsB1AV60 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NhsB1AV60 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NhsB1AV60 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NhsB1AV60 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NhsB1AV60 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NhsB1AV60 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NhsB1AV60 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NhsB1AV60 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NhsB1AV60 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NhsB1AV60 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NhsB1AV60 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NhsB1AV60 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NhsB1AV60 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NhsB1AV60 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NhsB1AV60 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NhsB1AV60 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NhsB1AV60 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NhsB1AV60 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NhsB1AV60 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NhsB1AV60 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NhsB1AV60 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NhsB1AV60 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NhsB1AV60 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NhsB1AV60 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NhsB1AV60 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NhsB1AV60 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NhsB1AV60 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NhsB1AV60 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NhsB1AV60 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NhsB1AV60 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NhsB1AV60 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NhsB1AV60 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NhsB1AV60 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NhsB1AV60 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NhsB1AV60 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NhsB1AV60 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NhsB1AV60 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NhsB1AV60 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NhsB1AV60 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NhsB1AV60 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NhsB1AV60 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NhsB1AV60 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NhsB1AV60 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NhsB1AV60 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NhsB1AV60 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NhsB1AV60 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NhsB1AV60 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NhsB1AV60 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NhsB1AV60 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NhsB1AV60 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NhsB1AV60 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NhsB1AV60 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NhsB1AV60 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NhsB1AV60 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NhsB1AV60 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NhsB1AV60 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NhsB1AV60 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NhsB1AV60 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NhsB1AV60 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NhsB1AV60 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NhsB1AV60 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NhsB1AV60 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NhsB1AV60 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NhsB1AV60 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NhsB1AV60 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NhsB1AV60 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NhsB1AV60 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NhsB1AV60 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NhsB1AV60 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NhsB1AV60 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NhsB1AV60 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms