Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem238A9JSM3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms