Protein–RNA interactions for Protein: A8HG57

Gm21904, Predicted gene, 21725, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21904A8HG57 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21904A8HG57 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21904A8HG57 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms