Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prss40A6H6T1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss40A6H6T1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms