Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Plcb2A3KGF7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Plcb2A3KGF7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms