Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp8b5A3FIN4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp8b5A3FIN4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp8b5A3FIN4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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