Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CatsperbA2RTF1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CatsperbA2RTF1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms