Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Htra4A2RT60 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htra4A2RT60 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms