Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb1A2AQ07 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms