Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll9A2APC3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll9A2APC3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms