Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd4A2AFR3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms