Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930447F04RikA2AFR2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms