Protein–RNA interactions for Protein: A2AF47

Dock11, Dedicator of cytokinesis protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 2,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dock11A2AF47 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Dock11A2AF47 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dock11A2AF47 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dock11A2AF47 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dock11A2AF47 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dock11A2AF47 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dock11A2AF47 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dock11A2AF47 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Dock11A2AF47 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dock11A2AF47 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dock11A2AF47 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dock11A2AF47 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Dock11A2AF47 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Dock11A2AF47 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dock11A2AF47 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dock11A2AF47 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Dock11A2AF47 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dock11A2AF47 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dock11A2AF47 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Dock11A2AF47 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dock11A2AF47 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Dock11A2AF47 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Dock11A2AF47 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dock11A2AF47 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms