Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sppl2cA2A6C4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2cA2A6C4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms