Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm6268A2A3U9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm6268A2A3U9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm6268A2A3U9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm6268A2A3U9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm6268A2A3U9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm6268A2A3U9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms