Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms