Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80eA0A0U1RP99 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms