Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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