Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQL3

Gm28102, Predicted gene 28102, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28102A0A087WQL3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28102A0A087WQL3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28102A0A087WQL3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28102A0A087WQL3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28102A0A087WQL3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28102A0A087WQL3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28102A0A087WQL3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28102A0A087WQL3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28102A0A087WQL3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28102A0A087WQL3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28102A0A087WQL3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28102A0A087WQL3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28102A0A087WQL3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28102A0A087WQL3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28102A0A087WQL3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms