Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Trav14-2A0A075B694 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Trav14-2A0A075B694 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Trav14-2A0A075B694 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Trav14-2A0A075B694 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Trav14-2A0A075B694 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trav14-2A0A075B694 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trav14-2A0A075B694 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trav14-2A0A075B694 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trav14-2A0A075B694 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Trav14-2A0A075B694 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Trav14-2A0A075B694 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Trav14-2A0A075B694 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trav14-2A0A075B694 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trav14-2A0A075B694 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trav14-2A0A075B694 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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