Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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OtofQ9ESF1 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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OtofQ9ESF1 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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OtofQ9ESF1 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
OtofQ9ESF1 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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