Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Ccdc47Q9D024 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
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