Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Dclk1-212ENSMUST00000199585 5196 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Csmd1Q923L3 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms