Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NipblQ6KCD5 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
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