Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1320-201ENSMUST00000096449 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr73-201ENSMUST00000099838 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm9434-201ENSMUST00000118975 813 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm24063-201ENSMUST00000157491 105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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