Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Irx1P81068 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms