Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm15704-201ENSMUST00000144757 2818 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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Hoxd10P28359 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Hoxd10P28359 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Hoxd10P28359 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms