Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm12354-201ENSMUST00000124319 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC153968.1-201ENSMUST00000215584 334 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Olfr1278-206ENSMUST00000216229 6819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Eif4a2-202ENSMUST00000077605 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Ablim3-202ENSMUST00000166783 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Heatr9-201ENSMUST00000019069 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Pkp4-203ENSMUST00000112577 4222 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Ly6a-202ENSMUST00000186526 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC123069.1-201ENSMUST00000215094 824 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Olfr984-201ENSMUST00000056795 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Glt8d2-201ENSMUST00000020485 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Clcn1Q64347 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms