Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hoxc11P31313 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Hoxc11P31313 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Hoxc11P31313 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Hoxc11P31313 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Hoxc11P31313 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Hoxc11P31313 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Hoxc11P31313 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Hoxc11P31313 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Hoxc11P31313 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms