Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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OtofQ9ESF1 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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OtofQ9ESF1 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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OtofQ9ESF1 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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OtofQ9ESF1 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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