Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CipcQ8R0W1 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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