Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Ucma-205ENSMUST00000195688 554 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm40117-201ENSMUST00000198827 369 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 4930573I07Rik-202ENSMUST00000199120 413 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 AC161763.1-201ENSMUST00000227063 168 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Olfr45-201ENSMUST00000084454 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Glul-201ENSMUST00000086199 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Tmem135-201ENSMUST00000041968 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 AC114002.1-201ENSMUST00000218097 2409 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Lpl-201ENSMUST00000015712 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Rufy4-201ENSMUST00000080167 2306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Psmb11-201ENSMUST00000097177 4247 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm35048-201ENSMUST00000192105 2802 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Pla2g16-201ENSMUST00000025925 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Arhgap27-201ENSMUST00000041385 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Cel-201ENSMUST00000028161 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Best3-201ENSMUST00000020378 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Tmprss11d-201ENSMUST00000031175 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 4930556L07Rik-201ENSMUST00000134422 1490 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Mfsd8-201ENSMUST00000026859 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Asgr1-203ENSMUST00000108585 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm13397-201ENSMUST00000119562 878 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Trim35Q8C006 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm5150-202ENSMUST00000194367 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm44131-201ENSMUST00000203036 394 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm7924-201ENSMUST00000203975 785 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 AC140264.1-201ENSMUST00000220023 469 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Pard3b-201ENSMUST00000046673 3426 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Xpnpep2-202ENSMUST00000114998 3017 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Rab3il1-203ENSMUST00000121418 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Trim35Q8C006 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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