Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SbdsP70122 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SbdsP70122 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SbdsP70122 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SbdsP70122 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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